Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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