Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms