Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
E130208F15RikQ3UPV3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms