Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms