Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Parp3Q3ULW8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms