Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms