Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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