Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHA3

Spg11, Spatacsin, mousemouse

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg11Q3UHA3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Spg11Q3UHA3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms