Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rnf180Q3U827 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rnf180Q3U827 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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