Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fndc4Q3TR08 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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