Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms