Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Hddc2Q3SXD3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms