Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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