Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VgfQ0VGU4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms