Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ttc39dQ0VF76 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ttc39dQ0VF76 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ttc39dQ0VF76 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ttc39dQ0VF76 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ttc39dQ0VF76 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Ttc39dQ0VF76 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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