Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atp2b3Q0VF55 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atp2b3Q0VF55 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atp2b3Q0VF55 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atp2b3Q0VF55 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atp2b3Q0VF55 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atp2b3Q0VF55 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atp2b3Q0VF55 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atp2b3Q0VF55 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Atp2b3Q0VF55 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Atp2b3Q0VF55 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atp2b3Q0VF55 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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