Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms