Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms