Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ubxn2bQ0KL01 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms