Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms