Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Kcnb1Q03717 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnb1Q03717 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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