Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tff2Q03404 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms