Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms