Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VcpQ01853 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VcpQ01853 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
VcpQ01853 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms