Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cacna1cQ01815 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cacna1cQ01815 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms