Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms