Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gjb2Q00977 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms