Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rbp4Q00724 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms