Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms