Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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