Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TgfbiP82198 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TgfbiP82198 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TgfbiP82198 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TgfbiP82198 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TgfbiP82198 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TgfbiP82198 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TgfbiP82198 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TgfbiP82198 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms