Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Otx2P80206 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms