Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tp53bp1P70399 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tp53bp1P70399 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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