Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rad54lP70270 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rad54lP70270 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms