Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkn1P70268 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms