Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Acta1P68134 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Acta1P68134 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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