Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab3cP62823 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms