Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rab1AP62821 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab1AP62821 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms