Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Snrpd1P62315 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snrpd1P62315 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snrpd1P62315 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snrpd1P62315 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snrpd1P62315 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Snrpd1P62315 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms