Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms