Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpl27P61358 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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