Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Strn4P58404 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Strn4P58404 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Strn4P58404 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Strn4P58404 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Strn4P58404 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Strn4P58404 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Strn4P58404 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Strn4P58404 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms