Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms