Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TspoP50637 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TspoP50637 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TspoP50637 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TspoP50637 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TspoP50637 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TspoP50637 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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