Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl11P48298 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl11P48298 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ccl11P48298 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl11P48298 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl11P48298 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl11P48298 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl11P48298 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl11P48298 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl11P48298 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl11P48298 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl11P48298 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccl11P48298 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl11P48298 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ccl11P48298 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Ccl11P48298 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl11P48298 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl11P48298 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl11P48298 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl11P48298 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl11P48298 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccl11P48298 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Ccl11P48298 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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