Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mmp9P41245 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mmp9P41245 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms