Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RxrgP28705 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms