Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxd12P23812 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd12P23812 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd12P23812 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd12P23812 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Hoxd12P23812 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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