Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms