Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tnnc1P19123 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms